TEADUS.BIOINF - Bioinformaatika ja arvutusliku bioloogia list
Bioinformaatika on interdistsiplinaarne uurimisvaldkond mis tegeleb
bioloogiliste andmete haldamise, analüüsi ja tõlgendamisega.
Teadus.Bioinf listsis käsitletavad teemad võivad puudutada väga paljusid
eri aspekte. Bioinformaatika tüüpilised uurimisvaldkonnad on näiteks
- molekulide 1-D ja 3-D vaheliste seoste uurimine (struktuur)
- valkude funktsiooni uurimine, valkude (homoloogia) võrdlemine
- genoomika, võrdlev genoomika (kogu organismi DNA uurimine)
- geenide regulatsioon ja regulatoorsete suhete modelleerimine
- ainevahetus/metabolism
- evolutsioonilise kauguse arvutamine
jne.
Üks bioinformaatika kui iseseisva teadusvaldkonna peamisi eesmärke on
võimalike uute analüüsimeetodite väljatöötamine. Võtmesõnadeks sellised
nagu "data mining", infosüsteemid, "high-performance computing",
formaalsed keeled ja grammatikad (deterministlikud ja stohhastilised),
modelleerimine, mudelite simuleerimine, jne jne. Neid meetode ei tule
arendada mitte niivõrd kui väärtust iseeneses kuivõrd neid tuleb
arendada realistliku bioloogilise mudeli kontekstis. Bioinformaatika
loob uusi abivahendeid, seega ei saa unustada ka bioinformaatika
meetodite kui abivahendi kasutust. Teemaga haakub kõik mis seotud
olemasolevate tööriistade ja andmebaaside kasutamisega. Ja viimasena,
kuid mitte vähemtähtsana - bioinformaatikaga on seotud ka kogu
programmeerimisega seotud temaatika.
Bioinformaatika on interdistsiplinaarne valdkond kus eri erialade
esindajatel kõigil on oma kogemus võimalik sisse tuua. Kutsun üles
listiga liituma kõiki kellele see teema huvi võiks pakkuda -
informaatika/arvutiteaduse esindajaid, biolooge, statistikuid,
biokeemikuid, füüsikuid, jt.
TEADUS.BIOINF listi haldur on Jaak Vilo
vilo@ut.ee, http://www.quretec.com/~vilo/
----------------------------------------------------------------------
Ajalugu:
10.10.2000 TEADUS.BIOINF list avatud
13.10.2000 Peale esialgset viivitust on laiali saadetud info
listi asutamise kohta
2003 Bioinformaatika õppetool TÜMRI-s (Prof. Maido Remm)
2007 Bioinformaatika õppetool BIIT ATI-s (Prof Jaak Vilo)
|